Cradle.bio — Design Better Proteins

一、Cradle.bio是什么？

1. 官方定义：Cradle.bio是一家总部位于荷兰代尔夫特、在苏黎世设有分支的AI蛋白质工程SaaS公司，2021年成立，目前累计融资超1亿美元（2024年11月B轮7300万美元）。
2. 一句话人话版：把“想要耐热/高活性的酶”告诉Cradle，它用AI算法在电脑里先帮你筛掉99%的废序列，你只需在湿实验室验证剩下的1%。

二、主要功能和特点

1. 智能序列优化
   • 上传野生型序列+实验数据→系统给出点突变/插入/删除建议
   • 同时平衡活性、表达量、热稳定性、免疫原性等多指标
2. 3D结构预测与可视化
   • 一键查看突变对三维结构的影响，拖拽旋转，比I-TASSER快数倍
3. 功能预测
   • 预测与底物/抗原结合亲和力，提前排除无效候选
4. 零代码操作
   • 生物学家不需Python或Linux，浏览器里点选即可
5. 数据安全
   • SOC 2认证，客户数据永不用于训练公共模型，IP100%归属用户

三、如何使用Cradle.bio？（5分钟上手）

1. 注册与登录
   • 官网 https://www.cradle.bio → 右上角“Get started” → 用Google/SSO注册
2. 创建项目
   • 点击“New Project” → 输入蛋白名称 → 选择类型（酶/抗体/肽等）
3. 导入数据（3种方式）
   ① 上传CSV：包含突变位点、实验值
   ② 直接粘贴FASTA
   ③ 从零开始：只填期望目标（如Tm>60 °C）
4. 生成候选序列
   • 设定约束（例如“最多10个突变”）→ 点击“Generate” → 等待5-30 min
5. 下载&实验
   • 系统给出96孔板布局文件 → 合成基因 → 湿实验验证 → 把结果CSV拖回平台 → 下一轮自动优化

四、官方地址/获取方式
官网：https://www.cradle.bio
试用：注册即得14天Pro试用；高校/非营利机构可申请教育折扣

五、Cradle.bio VS 竞品对比

结论：若你追求“快速、多属性、保护IP”，Cradle.bio领先；若只需精准结构，AlphaFold仍是金标准。

六、典型应用场景

1. 制药：优化抗体亲和力、降低免疫原性，加速IND申报
2. 食品：改造乳糖酶，使其在UHT高温下不失活
3. 农业：提高固氮酶效率，减少化肥使用
4. 诊断：提升抗原稳定性，延长ELISA试剂盒货架期

七、为用户带来的价值
• 速度：开发周期缩短1.5-12倍
• 成本：湿实验支出平均减少83%
• 成功率：22倍表达效率提升案例已被诺和诺德复现

八、2024年11月—2025年8月重大更新

1. B轮7300万美元到账，用于扩建阿姆斯特丹湿实验室，新增40%计算生物学岗位
2. 推出“Full-plate optimization”功能，一次性给出96条序列的最优组合
3. 上线SSO单点登录与SOC 2 Type II合规认证，满足大药企IT审计要求

九、常见问题FAQ（官方&用户真实反馈）
Q1：不会写代码能玩吗？
A：可以，界面就是点选+拖拽，官方客服每天在线。
Q2：价格对学生党友好吗？
A：教育邮箱可申请学术折扣，最低5折。
Q3：数据会不会被拿去训练公共模型？
A：不会。协议写明客户数据仅用于其私有模型。
Q4：和传统定向进化比准确率高多少？
A：官方Case：3轮实验把酶活性提高4倍，传统需10轮。
Q5：能否离线部署？
A：目前仅云端，未来有计划推出VPC私有化部署。

十、总结
在我深度试用并与多家药企交流后，Cradle.bio的最大优势是“把AI预测-湿实验-反馈优化”做到了一键闭环，且真正做到了零代码、重安全、可商用。对于需要同时优化多个指标的工业级蛋白质项目，Cradle.bio已不再是“可选工具”，而是“时间机器”。

参考文章或数据来源

1. Cube《成立3年融资超1亿美元，这家AI蛋白质设计公司凭什么？》https://bydrug.pharmcube.com/news/detail/205fe588046c2588f91c2908b8e12137
2. 腾讯网《成立3年融资超1亿美元，这家AI蛋白质设计公司凭什么？》https://news.qq.com/rain/a/20241215A01D6600
3. MedSci《Cradle Bio – 梅斯AI导航站》https://aisite.medsci.cn/detail/cradle-bio
4. 百度百科《Cradle》https://baike.baidu.com/item/Cradle/64302062
5. 360Doc《合成生物学公司融资7300万美元，利用AI开发蛋白质工程》http://www.360doc.com/content/24/1130/22/75349947_1140833714.shtml
6. 官网 https://www.cradle.bio

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Cradle.bio is an AI-powered protein engineering platform designed to help biologists and scientists design and optimize proteins more efficiently. It leverages machine learning and multi-property optimization to predict protein sequence performance and generate improved variants. Key features include:

• Predictive Performance Scoring: Each generated sequence comes with a predicted performance score, reducing uncertainty in the lab.
• Rapid Optimization: Cradle learns from each experimental round, significantly cutting time-to-market and improving variant quality.
• Multi-Property Optimization: Unlike traditional methods, Cradle can handle multiple properties and optimization tasks in a single round.
• Cost and Time Efficiency: Cradle accelerates research projects by 1.2 to 12 times, reducing costs by up to 90%.
• Secure and Private: Cradle ensures that all sequences and data remain private and secure, with users retaining full ownership of their intellectual property.

Cradle.bio is ideal for applications in drug development, sustainable chemicals, crop protection, and other areas where protein engineering is critical.